自由基诱导解离(OAD)技术加速非靶向脂质组学研究
本文由东京农工大学教授、MS-DIAL*席专家Dr. Hiroshi Tsugawa,岛津工程师Hidenori Takahashi,日本理化研究所Haruki Uchino,日本庆应义塾大学Omega-3脂质组学专家Dr. Makoto Arita共同合作完成。
文章发表于COMMUNICATIONS CHEMISTRY | (2022)5:162 | https://doi.org/10.1038/s42004-022-00778-1|
一、研究背景
脂质是生物体的基本化合物,具有多种生理功能,如细胞膜的组成部分、信号传递介质、能量储存和上皮屏障的形成。脂质的结构多样性是由分子骨架、极性头基团、酰链、双键位置等不同组合产生的。而双键(C = C)的位置是生物系统中的一个关键因素,但尚未被全面表征。
二、研究结果
联合研究小组使用一种结合自由基诱导解离技术(OAD)和计算质谱(CompMS)的方法,通过提高注释率来解决C = C位置分辨的非靶向脂质组学问题。联合研究小组首先分析了85种脂质标准品,验证了脂质结构和OAD-MS/MS谱图的关联性。结果表明,OAD可以分析不同血脂类别(磷脂、鞘脂、甘油脂、脂肪酸酰基)和侧链类型( O-酰基、N酰基、鞘脂碱骨架)内的C=C位置。
研究团队开发了MS-RIDD的软件,以促进使用CID-MS/MS和OAD-MS/MS的融合数据开展非靶向脂质组学研究。
该方法被应用于分析人类血浆和小鼠组织(肝脏、大脑、眼睛、皮肤、睾丸和粪便)的样本,最后成功鉴定了648种脂质物种,这些独特脂质达到C = C位置分辨水平。同时阐明了含有n-3和/或n-6超长链PUFAs(碳≥28,双键≥4)的组织特异性脂质在小鼠的眼睛、睾丸和大脑中的独特分布。
图1脂质OAD解离机理概述。a. OAD解离机理b. PC 18:0/18:1(n-9)的OAD-MS/MS谱和碎片离子的推定亚结构。键的解离发生在三个位置(红色、黄色和紫色),产物离子的m/z值由红色、黄色和紫色表示。产物离子的理论m/z值随化学结构描述,而实验m/z值和相应的ppm质量精度在MS/MS谱折线图中显示。
图2使用碰撞诱导解离(CID)和自由基诱导解离(OAD)综合策略开展非靶向脂质组学研究。a. LC-CID-MS/MS和LC-OAD-MS/MS的并行数据采集,综合数据处理方法包含数据预处理,包括峰提取,峰对齐,MS/MS谱图匹配和标注。b. MS-RIDD是确定C = C位置的核心工具。
主要算法过程包括四个步骤:(1) 基于脂质分子信息生成理论上可能的候选结构 (2) 根据解离规则计算参考的中性丢失表 (3) 验证每个C = C位置必要的诊断离子 (4) 通过平方根变换值计算MS/MS谱相似度,优先考虑结构性候选离子的强度。
三、研究结论
岛津提供了一个用于深入研究脂质分子水平的强大工具——自由基诱导解离技术(OAD),这对于理解脂质在生物学系统中的作用至关重要。结合研究团队开发的MS-RIDD软件,实现了非靶向脂质组学数据的自动化注释和智能化处理。通过以上技术方法提高了脂质结构注释的准确率,并成功地鉴定了648种独特的脂质,这些脂质包含24种由LIPIDMAPS定义的脂质亚类,并且具有C = C位置分辨水平。这项研究不仅提高了对脂质C = C位置异构体的表征能力,而且为疾病机制的探索、生物标志物的识别和疾病复杂病理学的阐明提供了新的技术手段。
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